Situé sur la côte orientale de l'île éponyme, le port de Lipari est le principal port de l'archipel des Éoliennes. De part son importance, diverses activités sont exercées par le port de Lipari : plaisance, ferry, pêche...qui est divisé en différents quais Port touristique, Marina Lunga et Marina Corta.
Le port de Lipari est connecté quotidiennement au port de Milazzo, situé sur la côte septentrionale sicilienne. Des traversées régulières sont également programmées de Lipari à destination des autres îles de l'archipel des Éoliennes : Salina, Vulcano, Stromboli, Panarea, Filicudi et Alicudi.
Durant la période estivale, des ferries peuvent être déployés vers les ports de la péninsule italienne de Reggio Calabria, Vibo Valentia, Sapri, Salerne et Naples Mergellina et vers deux autres ports siciliens de Messine et Palerme.
Les compagnies maritimes, qui proposent des départs pour Lipari, sont Liberty Lines, Alilauro, Snav et Siremar déployant des hydroptères modernes et rapides ou des ferries confortables.
Le port de Lipari est à proximité immédiate du centre-ville qui dispose de toutes les infrastructures pour accueillir les touristes comme bars, restaurants, boutiques d'artisanat, supermarchés, banques et hébergements.
